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title: "Compara análogos con la similitud de Tanimoto: plugin Compare molecules | Blog de MolDraw"
url: https://www.moldraw.com/es/blog/compare-molecules-plugin-tanimoto-similarity.html
description: "Mide cuánto se parecen dos o más moléculas. Guía práctica de la similitud de Tanimoto, la similitud funcional y el plugin gratuito Compare molecules de MolDraw."
lang: es
publisher: Scidart Academy
generated: 2026-10-26
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# Compara análogos lado a lado con la similitud de Tanimoto en MolDraw

Publicado: 15 oct. 2026 · Autor: Scidart Academy · Tiempo de lectura: ~6 min

![Paracetamol y fenacetina uno al lado del otro con un indicador de similitud de Tanimoto debajo](https://www.moldraw.com/blog/thumbs/compare-molecules-plugin.webp)

Compare molecules mide con la similitud de Tanimoto cuánto se parecen dos estructuras.

**Respuesta corta:** instala **Compare molecules** desde Settings › Plugins, dibuja tu molécula de referencia, abre la pestaña **Compare** y pulsa **Add canvas**. Pega otras estructuras como SMILES, una por línea, y pulsa **Add SMILES**. Cada fila muestra una puntuación de similitud estructural (Tanimoto), una puntuación de similitud funcional y una breve lista de cambios. Pulsa **CSV** para exportar la tabla.

## ¿Por qué ponerle un número a "parecido"?

Los químicos dicen continuamente que dos moléculas son "parecidas". Pregunta a tres personas cuánto se parecen el paracetamol y la aspirina y obtendrás tres respuestas. Una puntuación de similitud da a todos la misma vara de medir.

Eso importa cuando trabajas con una serie de análogos, eliges compuestos para ensayar o enseñas relaciones estructura–actividad. Una puntuación te permite ordenar una lista en lugar de juzgarla a ojo. Una lista de cambios te dice qué difiere realmente de la referencia.

## Qué significa la similitud de Tanimoto

Primero, el software convierte cada molécula en una **huella molecular** (fingerprint): una larga fila de bits encendidos o apagados. Cada bit registra si está presente un rasgo estructural, como un anillo o un fragmento pequeño.

El **coeficiente de Tanimoto** compara dos huellas. Cuenta los bits activados en ambas moléculas y divídelos entre los bits activados en cualquiera de ellas. Si la molécula A tiene *a* bits activados, B tiene *b* y comparten *c*, entonces T = c / (a + b − c). Una puntuación de 1 (100 %) significa que las huellas son idénticas. Una puntuación de 0 significa que no comparten ningún rasgo.

Ten en cuenta tres cosas:

- La puntuación depende de la huella. El mismo par puede puntuar distinto en programas diferentes, así que compara números solo dentro de una misma herramienta.
- Este tipo de huellas ignora la estereoquímica. Dos enantiómeros tienen la misma huella.
- Las estructuras parecidas suelen tener actividad parecida, pero no siempre. Un pequeño cambio puede anular la actividad.

## Qué muestra el plugin

![Plugin Compare molecules de MolDraw con el cloranfenicol como referencia, comparado con el ácido salicílico y el paracetamol, que muestra los porcentajes de similitud estructural y funcional](https://www.moldraw.com/docs/img/plugin-compare-molecules-annotated-screenshot.webp)

El cloranfenicol como referencia, junto al ácido salicílico y el paracetamol. Cada fila tiene dos puntuaciones y una lista de cambios.

| Similitud estructural | Puntuación de Tanimoto sobre una huella estructural (mismos átomos y enlaces). |
| --- | --- |
| Similitud funcional | Similitud de rasgos farmacofóricos: donadores y aceptores de enlaces de hidrógeno, anillos aromáticos, cargas, halógenos y grupos hidrófobos. |
| Cambios | Diferencias respecto a la referencia en lenguaje claro, como Cl → H, además de notas como una diferencia de estereocentro o de protonación. |
| 2D, 3D, Properties | Dibujos lado a lado con las diferencias coloreadas, una superposición 3D con RMSD y una tabla de propiedades fisicoquímicas y de druglikeness. |
| CSV | Exporta la tabla de comparación con puntuaciones, cambios y valores de propiedades. |

## Cómo instalar Compare molecules

1. Abre el [editor MolDraw](https://www.moldraw.com/es/) e inicia sesión. Basta con una cuenta gratuita.
2. Haz clic en **Settings** (el engranaje) y después en **Plugins**.
3. Haz clic en **Install** junto a Compare Molecules. Aparece una pestaña **Compare** en el panel de análisis.

## Cómo comparar una serie paso a paso

1. Dibuja la molécula de referencia en el lienzo.
2. Abre la pestaña **Compare** y pulsa **Add canvas**. La primera molécula de la lista es la referencia. Si el lienzo contiene varias moléculas, se añade cada una de ellas.
3. Pega más estructuras en el cuadro de SMILES, una por línea. Puedes añadir un nombre tras un espacio, por ejemplo `CC(=O)Nc1ccc(O)cc1 paracetamol`.
4. Pulsa **Add SMILES**. Ahora cada fila muestra sus puntuaciones frente a la referencia.
5. Haz clic en una fila para ver **Reference** y **Selected** lado a lado. Los átomos coloreados marcan las diferencias **Stereo**, **Charge** y **Not shared**. Cuando las dos comparten un núcleo, marca **Overlay** para dibujar una encima de la otra.
6. Cambia a **3D** y pulsa **Run 3D comparison** para superponer confórmeros, o a **Properties** para ver una tabla de propiedades lado a lado.
7. Haz clic en la estrella de cualquier fila para convertirla en la nueva referencia. Pulsa **CSV** para guardar la tabla, o **Clear** para empezar de nuevo.

## Usos en clase y en el laboratorio

- **Enseñar estereoisómeros:** compara una molécula con su enantiómero. La puntuación de Tanimoto es del 100 %, pero la nota indica que las estructuras difieren en un estereocentro. Así los estudiantes ven por qué una huella no lo dice todo.
- **Ácidos y sus sales:** compara un ácido carboxílico con su carboxilato. El plugin indica que el esqueleto es el mismo y que difieren la carga o la protonación.
- **Series de análogos:** pega una lista de análogos y lee la columna de cambios. Verás de un vistazo qué posición del anillo o qué sustituyente cambia cada uno.
- **Saltos de esqueleto (scaffold hopping):** una puntuación estructural baja con una puntuación funcional más alta puede indicar que un nuevo esqueleto conserva rasgos parecidos, como donadores, aceptores y anillos aromáticos.
- **Resultados de bases de datos:** en el [plugin ChEMBL](https://www.moldraw.com/es/blog/chembl-plugin-bioactivity-lookup.html), usa Send to Compare para añadir un compuesto directamente a la tabla.

## Consejos y limitaciones reales

- Lee la columna de notas, no solo la puntuación. Una puntuación de Tanimoto del 100 % puede ocultar diferencias de estereoquímica o de carga.
- Dibuja cuñas donde importe la estereoquímica, para que el plugin compare las configuraciones que pretendes.
- Las puntuaciones de similitud no predicen la actividad. Úsalas para organizar una serie y después revisa los datos.
- Los valores de la pestaña Properties son estimaciones. Las filas marcadas con un asterisco usan un descriptor sustituto.
- ¿Necesitas SMILES a partir de nombres? Usa el [conversor de nombre a SMILES](https://www.moldraw.com/es/tools/free-chem-tools/iupac-name-to-smiles-converter.html) y pega los resultados.

¿Cribas una serie por druglikeness? Combina la tabla con la [calculadora de la regla de los cinco de Lipinski](https://www.moldraw.com/es/tools/free-chem-tools/lipinski-rule-calculator.html).

## Preguntas y respuestas

### ¿Qué significa una puntuación de Tanimoto del 100 %?

Las dos huellas moleculares son idénticas. Eso no siempre significa que las moléculas lo sean, porque la huella ignora la estereoquímica. El plugin indica por separado en las notas las diferencias de estereocentros y de carga.

### ¿Qué diferencia hay entre similitud estructural y similitud funcional?

La similitud estructural es una puntuación de Tanimoto sobre una huella estructural, así que premia los mismos átomos y enlaces. La similitud funcional compara rasgos farmacofóricos: donadores y aceptores de enlaces de hidrógeno, anillos aromáticos, cargas, halógenos y grupos hidrófobos.

### ¿Puedo cambiar la molécula de referencia?

Sí. La primera molécula que añades es la referencia. Haz clic en la estrella de cualquier fila para convertir esa molécula en la referencia, y las puntuaciones se recalculan frente a ella.

### ¿El plugin Compare molecules es gratuito?

Sí. Se instala con una cuenta gratuita de MolDraw. La comparación se calcula en tu navegador con OpenChemLib.

## Más plugins de MolDraw

[Documentación de Compare molecules](https://www.moldraw.com/docs/plugins/compare-molecules-plugin-tanimoto-similarity/) [Bioactividad en ChEMBL](https://www.moldraw.com/es/blog/chembl-plugin-bioactivity-lookup.html) [pKa y microespecies](https://www.moldraw.com/es/blog/pka-plugin-protonation-states-microspecies.html) [Potencial electrostático (MEP)](https://www.moldraw.com/es/blog/mep-plugin-electrostatic-potential-map.html) [Todos los plugins](https://www.moldraw.com/docs/plugins/moldraw-plugins-overview-and-how-to-install/)

Última actualización: 15 de octubre de 2026